Chapter 6. Conseils sur les performances

Table of Contents
6.1. Petites tables de grandes géométries
6.1.1. Description du problème
6.1.2. Solutions de contournement
6.2. CLUSTER d'index géométriques
6.3. Eviter les conversions de dimension

6.1. Petites tables de grandes géométries

6.1.1. Description du problème

Les versions de PostgreSQL actuelles (y compris 8.0) souffrent d'une faiblesse optimiseur de requête relative les tables TOAST. Tables TOAST sont une sorte de «salle de l'extension" utilisé pour stocker de grandes valeurs (dans le sens de la taille des données) qui ne rentrent pas dans les pages de données normales (comme de longs textes, images ou des géométries complexes avec beaucoup de sommets), voir Documentation PostgreSQL pour TOAST pour plus d'informations).

Le problème apparaît s'il vous arrive d'avoir une table avec d'assez grandes géométries, mais pas beaucoup de lignes d'entre elles (comme un tableau contenant les frontières de tous les pays européens en haute résolution). Ensuite, le tableau lui-même est petit, mais il utilise beaucoup d'espace TOAST. Dans notre exemple, le cas, la table elle-même avait environ 80 lignes et seulement 3 pages de données utilisées, mais la table TOAST 8225 pages utilisé.

Maintenant émettre une requête en utilisant l'opérateur de géométrie && pour rechercher une boîte englobante qui correspond que très peu de ces lignes. Maintenant l'optimiseur de requêtes voit que la table n'a que 3 pages et 80 lignes. Il estime qu'une analyse séquentielle sur une telle petite table est beaucoup plus rapide que d'utiliser un index. Et alors il décide d'ignorer l'index GIST. Habituellement, cette estimation est correcte. Mais dans notre cas, l'opérateur && doit aller chercher chaque géométrie à partir du disque pour comparer les boîtes englobantes, et par conséquent la lecture de toutes les pages TOAST également.

Pour voir si vous souffrez de ce problème, utilisez la commande postgresql "EXPLAIN ANALYZE". Pour plus d'informations et les détails techniques, vous pouvez lire le fil de discussion sur la liste de diffusion sur les performances de PostgreSQL : http ://archives.postgresql.org/pgsql-performance/2005-02/msg00030.php

et un fil d'actualités plus récent sur PostGIS https://lists.osgeo.org/pipermail/postgis-devel/2017-June/026209.html

6.1.2. Solutions de contournement

Les personnes de PostgreSQL essayent de résoudre ce problème en faisant l'estimation de la requête TOAST-courant. Pour l'instant, voici deux solutions :

La première solution consiste à forcer le planificateur de requêtes à utiliser l'index. Envoyer "SET enable_seqscan TO off;" au serveur avant d'émettre la requête. Cela force le planificateur de requêtes à éviter balayages séquentiels lorsque cela est possible. Donc, il utilise l'index GIST comme d'habitude. Mais cet indicateur doit être fixé à chaque connexion, et il provoque le planificateur de requêtes à faire des erreurs d'estimation dans les autres cas, vous devrez donc faire "SET POUR enable_seqscan sur;" après la requête.

La deuxième solution consiste à faire le balayage séquentielle aussi vite que le planificateur de requêtes pense. Ceci peut être réalisé en créant une colonne supplémentaire qui "cache" la bbox, et contre cette correspondance. Dans notre exemple, les commandes sont comme :

SELECT AddGeometryColumn('myschema','mytable','bbox','4326','GEOMETRY','2');
UPDATE mytable SET bbox = ST_Envelope(ST_Force2D(geom));

Modifiez maintenant votre requête pour utiliser l'opérateur && contre bbox au lieu de geom_column, comme suit :

SELECT geom_column
FROM mytable
WHERE bbox && ST_SetSRID('BOX3D(0 0,1 1)'::box3d,4326);

Bien sûr, si vous changez ou ajoutez des lignes à mytable, vous devez garder la bbox "synchro". La façon la plus transparente pour ce faire serait des déclencheurs, mais vous pouvez également modifier votre application afin de maintenir la colonne bbox courante ou exécuter la requête UPDATE ci-dessus après chaque modification.

6.2. CLUSTER d'index géométriques

Pour les tables qui sont pour la plupart en lecture seule, et où un seul index est utilisé pour la majorité des requêtes, PostgreSQL offre la commande CLUSTER. Cette commande réorganise physiquement toutes les lignes de données dans le même ordre que les critères de l'index, ce qui donne deux avantages de performance : d'abord, pour des analyses d'intervalle de l'index, le nombre de recherche sur la table de données est considérablement réduit. Deuxièmement, si votre jeu de travail se concentre à quelques petits intervalles sur les index, vous avez une mise en cache plus efficace parce que les lignes de données sont dispersées sur moins de pages de données. (N'hésitez pas à lire la documentation de la commande CLUSTER du manuel PostgreSQL à ce stade)

Cependant, PostgreSQL ne permet actuellement pas le clustering sur les index GIST de PostGIS car les indices GIST ignorent les valeurs NULL, vous obtenez un message d'erreur comme :

lwgeom=# CLUSTER my_geom_index ON my_table;
ERROR: cannot cluster when index access method does not handle null values
HINT: You may be able to work around this by marking column "geom" NOT NULL.

Comme le message d'ASTUCES vous le dit, on peut contourner cette lacune en ajoutant une contrainte "not null" à la table :

lwgeom=# ALTER TABLE my_table ALTER COLUMN geom SET not null;
ALTER TABLE

Bien sûr, cela ne fonctionnera pas si vous avez besoin, dans les faits, de valeurs NULL dans la colonne de géométrie. En outre, vous devez utiliser la méthode ci-dessus pour ajouter la contrainte, en utilisant une contrainte CHECK comme "ALTER TABLE blubb ADD CHECK (geometry is not null)" ne fonctionnera pas.

6.3. Eviter les conversions de dimension

Il arrive parfois que vous ayez des données 3D ou 4D dans votre table, mais que vous y accédiez toujours à l'aide des fonctions ST_AsText() ou ST_AsBinary() conformes à OpenGIS qui ne produisent que des géométries 2D. Pour ce faire, elles appellent en interne la fonction ST_Force2D(), qui introduit une surcharge importante pour les géométries de grande taille. Pour éviter cette surcharge, il peut être possible de pré-déposer ces dimensions supplémentaires une fois pour toutes :

UPDATE mytable SET geom = ST_Force2D(geom);
VACUUM FULL ANALYZE mytable;

Notez que si vous avez ajouté votre colonne de géométrie à l'aide AddGeometryColumn (), il y aura une contrainte sur la dimension de la géométrie. Pour contourner vous devrez supprimer la contrainte. N'oubliez pas de mettre à jour l'entrée dans la table geometry_columns et recréer la contrainte par la suite.

En cas de grandes tables, il peut être judicieux de diviser cette mise à jour en petites portions en restreignant l'UPDATE à une partie de la table via une clause WHERE et votre clé primaire ou d'un autre critère, et exécutant un simple «VACUUM» ; entre votre mises à jour. Cela réduit considérablement le besoin d'espace disque temporaire. En outre, si vous avez des données géométriques de dimension mixte, restreindre la mise à jour en "WHERE dimension(the_geom)>2" saute la ré-écriture des géométries qui sont déjà en 2D.